Oi Fábio! 

Quando preciso apagar cards em massa, crio uma fase temporária e depois crio uma automação com evento de atividade recorrente para mover os cards para essa fase (importante incluir condicionais na automação para que não sejam movidos todos os cards do pipe para lá).

Depois que a automação move os cards, excluo a fase e todos os cards também são excluídos.

Espero que ajude!

Interessante Jéssica, vou testar em breve! Obrigado pela dica.

Olá Fábio.

Você pode usar o Graphiql.

O código abaixa apagaria os cards de 1 a 5.

mutation {
n2: deleteCard(input: {id: 1 }){success}
n3: deleteCard(input: {id: 2 }){success}
n4: deleteCard(input: {id: 3 }){success}
n5: deleteCard(input: {id: 4 }){success}
n6: deleteCard(input: {id: 5 }){success}
  }

Boa! É bem fácil, mas a dica do Fábio é bom também.