Para realizar essa tarefa por API esse material abaixo irá te ajudar!
O site que vai utilizar para fazer essa ação é o https://app.pipefy.com/graphiql
Lembrando que é necessário estar logado em sua conta no Pipefy (para que haja a autentificação) e ter a permissão de administrador na base de dados em que será realizada a ação.
É importante salientar que uma vez excluído não é possível restaurar as informações e a exclusão também afetará o histórico dos cards conectados a estes registros.
Assista o vídeo com o passo a passo aqui.
Em anexo você vai encontrar uma planilha que vai te auxiliar também!
Mais informações sobre API você encontra aqui.
Até mais!😉